藻井最早可追溯到北魏时期(公元前386-534)的云冈石窟、龙门石窟顶部的石雕莲花。在古人穴居时，顶上开洞以纳光、通光、上下出入，《礼记.礼运》记载：“昔者先王未有宫室，冬则居营窟，夏则居巢。”其外形像个凹进的井，“井”加上藻文饰样，所以称为藻井。现存最早的木构藻井，是蓟县独乐寺观音阁上的藻井，为方形抹去四角，上加斗八。
汉代（公元前202-220年）至唐初（公元618年-712年），文献中“藻井”是一种韵连续天花，方井中绘有倒悬莲花。汉人称其为“平机”或“乘尘”，这两个名称可以概括了其具有调节室内空间高低、除尘保暖等功效。
发展至宋朝(公元960-1279年），《营造法式》中明确将天花分为三类：平阁、平基和藻井。明代之后，藻井的发展由简而繁，由实用结构形状而演变为装饰的构造。藻井的构造和形式有了很大的发展，极尽精巧和富丽堂皇，除了规模增大之外，顶心用以象徵天国的明镜开始增大，周围放置莲瓣，中心绘云龙。后来这中心的云龙愈来愈得到强调。
到了清代就成为了一团雕刻生动的蟠龙。蟠龙口中悬垂吊灯，不失原来明镜的形式。由於清代的藻井流行能为顶心，於是便把藻井改称为“龙井”了。
